Komisja na zlecenie Rektora Uniwersytetu Jagiellońskiego opiniuje projekty wewnętrznych aktów prawnych, w tym w szczególności dotyczące zmiany Statutu Uniwersytetu Jagiellońskiego, a także podejmuje na wniosek Rektora Uniwersytetu Jagiellońskiego inne czynności, w tym w szczególności obejmujące przygotowanie projektów wewnętrznych aktów prawnych, o ile nie wchodzą one w zakres działania innych organów i jednostek.
Do zadań Komisji należy również przedstawianie Rektorowi Uniwersytetu Jagiellońskiego opinii w sprawach ewentualnych przypadków naruszania przepisów prawa dotyczących Uniwersytetu Jagiellońskiego.